一种精准分析单细胞APA位点的sc3T-seq方法

    公开(公告)号:CN116083531A

    公开(公告)日:2023-05-09

    申请号:CN202310082830.2

    申请日:2023-01-18

    Abstract: 本发明公开了一种精准分析单细胞APA位点的sc3T‑seq方法,涉及分子生物学和生物信息学领域,oligo(dT)20引物与链霉亲和素的磁珠孵育结合,加入少量起始样本和外源单链DNA,双链cDNA合成,双链cDNA断裂,移除polyA,释放带标签的cDNA,加入具有生物素标记的λ‑DNA,加入羧基磁珠,筛选去除外源cDNA,末端修复、加接头、构建cDNA文库,链霉素亲和磁珠去除生物素标记λDNA,得到纯净的样本文库。本发明降低了起始样品量,使分析APA位点的实验技术能够适用于少量样本甚至单个细胞,对于精准检测、分析细胞特异性的APA有很大的作用。

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