本实用新型涉及核酸检测技术领域，具体提供一种全自动核酸检测系统，旨在解决现有的核酸检测系统无法做到样品随到随检的问题。为此目的，本实用新型提供一种全自动核酸检测系统，所述核酸检测系统包括：第二温控模块，其设置有第三温控部，所述第三温控部包括多个第三温控孔，所述第三温控部具有第一工位和第二工位，所述第二温控模块包括第五移动机构；第一温控模块，其设置有第一温控部和第二温控部，所述第一温控部包括多个第一温控孔，所述第二温控部包括多个第二温控孔；第一抓取模块，其包括第一抓取机构和第一移动机构；第二抓取模块，其包括第二抓取机构和第二移动机构。