本申请涉及一种氢能发电站双路散热系统，其属于散热技术领域，该散热系统应用于氢能发电设备，氢能发电设备具有供导热介质流通的设备散热管道，该散热系统包括：第一电磁阀，为二位三通电磁阀，一个入口连接设备散热管道的输出端；供热管道，输入端连接第一电磁阀的一个出口，输出端连接设备散热管道的输入端；散热管道，输入端连接第一电磁阀的另一个出口，输出端连接设备散热管道的输入端；温度检测模块，用于检测目标供暖室内的温度，生成检测温度数据；温度比较模块，用于在检测温度数据低于第一预设温度数据时生成供热信号；以及控制模块，用于在接收到供热信号时控制第一电磁阀的入口和一个出口。本申请具有节约能源的效果。