本实用新型公开了一种燃气轮机主轴振动探头校验系统，包括电源模块、振动模块、探头校验装置；所述探头校验装置包括U型尺架，所述U型尺架的两个端部分别为第一端部和第二端部，所述第一端部和第二端部分别开有沿水平方向且位置对应的通孔，所述第一端部的所述通孔朝向所述第二端部的一端伸出测微螺杆，所述第二端部的通孔内表面设置有内螺纹，用于装入待校验的振动探头，且所述第二端部通孔的轴心与所述固定套管上的零点位置对齐，从而当装入待校验的振动探头时使所述振动探头的轴心与所述固定套管上的零点位置对齐。本实用新型能够在校验时牢固固定校验装置与振动探头，以及实现精度达到微米级的校验。