本实用新型涉及电力设备技术领域，具体涉及多端口电力电子变压器拓扑结构及其交直流微电网系统，所述的多端口电力电子变压器拓扑结构包括至少两个交流输入端；至少两组电压变换单元，与各个交流输入端口对应连接，每组电压变换单元包括预设数量的电压变换子单元，每个电压变换子单元输出至少两种电压等级的直流电压，每组电压变换单元中相同电压等级的直流电压输出端并联后形成每组电压变换单元的第一直流电压输出端；至少两组直流电压输出端，包括至少两组电压变换单元的第一直流电压输出端并联后的第二直流电压输出端；至少一组交流电压输出端，与第二直流电压输出端连接。具备高、低压，交、直流多种端口，可以实现灵活组网。