本实用新型公开了一种独立组合式循环水养殖的净化系统，包括竖流沉淀器、循环水泵、蛋白分离器、MBBR生物反应器、紫外线杀菌器、中央电子控制箱和箱体；所述循环水泵的水泵进水口与竖流沉淀器的沉淀出水口相连接；所述蛋白分离器和MBBR生物反应器的进水端分别与循环水泵的水泵出水口相连接，所述蛋白分离器和MBBR生物反应器的出水端均与紫外线杀菌器的进水端相连接。本实用新型设计合理，占地面积小，能耗低，造价低，移动安装、管理维护方便，水质净化效果好；该系统可适用于水珍品循环水暂养、吊水模式、小水体鱼苗循环水标粗系统、家庭式循环水养鱼致富模式、工厂化立体贝蟹循环水养殖系统的水体净化。