用于冷冻、解冻和贮存生物制药材料的系统包括适于接收生物制药材料以进行冷冻、解冻和贮存的挠性容器、导管和温度控制单元。容器由平的第一和第二挠性材料片通过接缝连接而成，当排空时，容器是扁平的。容器完全封闭成接收生物制药材料的内部。当充填生物制药材料时，容器形成具有第一侧和与第一侧相对的第二侧的三维形状。导管连接到容器上，容器外部通过导管与内部流体连通；温度控制单元包括第一表面和正对第一表面的第二表面，且当容器充填生物制药材料时，温度控制单元适于将容器接收于其内。容器与温度控制单元内部的形状一致，容器第一和第二侧与温度控制单元第一和第二表面接触。温度控制单元第一和/或第二表面包括传热表面。