通过将材料浸入装有冷却液的容器中、并以基本上恒定的预定速率和温度使冷却液环流通过该材料以冷冻此材料，从而将存活的生物材料进行低温保藏(低温保存)。所述材料可以无需制备直接浸入冷却液，或在冷冻之前进行化学制备。本发明的方法以足够快的速率冷冻生物材料，以避免在细胞结构内形成冰晶(玻璃化)，并可使样品保持解剖学结构且在解冻后仍有生化活性。冷却液的温度较佳为－20℃到－30℃，这个温度范围足够使细胞膜中由于热变化而导致的应力破坏的形成和其它人为构造减少到最小程度。与病理学和组织学技术所用的其它低温保存法冷冻的细胞相比，采用本发明方法冷冻的细胞具有明显较小的细胞和细胞内损伤。由于本发明可冷冻生物材料，这样材料被玻璃化，故冷冻后细胞内的生化活性未受损失，因此本发明的各种实施方案可用于系统，以为制备生物材料值这项低温病理学和免疫组织化学的新技术用于研究和患者护理领域。