本发明公开的属于联轴器法兰加工技术领域，具体为一种联轴器法兰孔加工方法及其设备，包括支架，所述支架的底端设有能够对两组联轴器法兰进行固定的夹持组件，所述支架的内腔设有钻孔组件，所述支架的顶端设有能够对钻孔组件的位置进行调节的调节组件。本发明通过设置能够对两组联轴器法兰进行固定的夹持组件，以及通过设置能够对钻孔组件的位置进行调节的调节组件，具有能够解决现有的钻孔设备通常每次只能对一组‌联轴器法兰进行钻孔的问题，进而能够在一定程度上提高对联轴器法兰的钻孔效率。