本发明公开了去氧青蒿素B合酶及其同工酶A0A2U1PPI9在催化二氢青蒿酸生物合成二氢去氧青蒿素B中的应用。本发明在青蒿素的生物合成途径中，首次公开了二氢青蒿酸生物合成二氢去氧青蒿素B的过程，通过生物信息学分析及候选酶的体外活性验证，表明去氧青蒿素B合酶及其同工酶A0A2U1PPI9均具有催化二氢青蒿酸生物合成二氢去氧青蒿素B的新功能，丰富了青蒿素生物合成途径的线路，为青蒿素的终端生物合成途径的解析及青蒿素类化合物的异源合成提供理论基础。