本发明公开了一种掺混肥的清洁生产工艺，包括以下步骤，原料准备与选择；对不同原料进行一次造粒，得到均匀的颗粒原料；颗粒原料进行封闭通风保存；对颗粒原料进行配料和计量；混合及搅拌；最后进行包装，原料经过对辊挤压成型的一次造粒的4‑5mm颗粒，外观状态一致，经过挤压排除了原料中的空气，压缩了间隙，使成型的颗粒密度和比重趋于统一，这种原料进行掺混不会出现因颗粒大小、密度差以及吸附能力不同而产生的掺混分层，掺混后的复合肥符合国际通用的掺混肥配比原则，可以达到均化完全的掺混肥品质要求，既节约了加工成本，提高了生产效率，而且有效克服了原料结块的问题。