本发明属于NH3‑SCR催化技术领域，涉及一种抗碱金属中毒的稀土基铜分子筛脱硝催化剂的制备方法和应用。本发明以硅源、铝源、碱源、模板剂、水、稀土源和螯合剂的混合物为第一反应体系，水热反应后，经过滤、干燥、焙烧，得到第一反应产物；将第一反应产物与铵源混合后，作为第二反应体系，经第一微波超声反应，得到第二反应产物；将第二反应产物与铜源混合后，作为第三反应体系，经第二微波超声反应，得到第三反应产物；对第三反应产物进行焙烧处理即得所述抗碱金属中毒的稀土基铜分子筛脱硝催化剂。其具有优异的抗碱金属中毒性能以及催化活性。