本发明公开了一种双仓式好氧堆肥发酵装置，涉及发酵装置技术领域，包括第一仓体，所述第一仓体底部位置固定连接有第一支架，所述第一仓体的表面固定安装有控制面板，所述第一仓体的顶面固定连接有顶板，所述顶板的顶面一侧固定连接有进入斗，所述第一仓体的一端固定连通有通料箱，所述通料箱的底端设置有传送箱，所述传送箱的一侧位于第二仓体的底部位置，所述第二仓体的底端固定连接有第二支架。本发明结构合理，通过第一仓体对堆肥进行加热初步处理工作，然后通过传料组件将预处理好的堆肥传送到第二仓体的内部进行再次处理，对余热的气体进行收集工作，最后通过出料管进行排出。