本发明公开了一种基于DNN和共识聚类的因心脑血管疾病死亡人群聚类方法及装置，涉及生物数据处理领域，包括：获取用于聚类的指标，对指标进行多元COX回归，筛选出分析指标；构建基于深度神经网络的人群分类模型并训练，得到经训练的人群分类模型；将待分析人群中的每个个体的分析指标输入经训练的人群分类模型，得到分类结果，以确定待分析人群中的存活人群和因心脑血管疾病死亡人群；获取因心脑血管疾病死亡人群中的每个个体的分析指标通过经训练的人群分类模型的最后一个隐藏层输出得到的高级特征，基于高级特征采用共识聚类对因心脑血管疾病死亡人群进行聚类，得到聚类结果。本发明解决了难以识别因心脑血管疾病死亡人群的不同子集的问题。