本发明公开了一种KIF5C突变动物模型的构建方法及其应用。本发明首次在孤独症患儿的基因组中发现KIF5C基因发生突变，其突变位点为c.2344G>A；为此，基于该突变位点，本发明提供了一种特异性靶向KIF5C突变基因的sgRNA和包含sgRNA试剂盒，通过该试剂盒可基于CRISPR/Cas9基因编辑技术构建得到KIF5C突变基因(c.2344G>A)敲入动物模型；该动物模型敲入效率高、可控性高、重复性好、易于繁殖饲养，弥补了现有动物模型的不足，且更稳定、更加符合临床特点，有助于孤独症疾病的致病机制的研究以及孤独症疾病药物的研发；具有良好的医学临床应用前景。