本申请实施例提供的一种基于多波束水深数据的洋底构造解释方法与系统，通过对多波束水深数据剥离沉积物覆盖影响，获取地形数据，利用高通滤波器滤除区域性岩浆作用形成的长波信号，保留由构造运动导致的局部地形起伏，通过提取地形要素，识别断裂与火山构造的位置与展布规律，并计算断层的离轴活动范围，依据断裂和火山的组合特征，确定构造地貌类型与分布特征，重建海底扩张构造‑岩浆过程演化历史。本发明可快速、精确地表征洋中脊扩张过程中的岩浆‑构造演化规律，实现断裂、岩浆活动与地磁年代学的时‑空标定，以及扩张过程中岩浆增生和构造拉张组分的定量化解释，为海底油气和热液矿产资源的勘查工作提供指导。