本申请公开了一种复叠制冷系统及其控制方法和制冷设备，属于制冷领域。其中复叠制冷系统包括共用一个中间换热器的高温制冷循环回路和低温制冷循环回路；在低温制冷循环回路中设置了旁通管路，旁通管路一端连接中间换热器的出液口，另一端连接所述低温级压缩机的回气侧，旁通管路上设置有膨胀罐和进口电磁阀和出口电磁阀，当排气压力大于第一阈值时，即排气压力较大时，进口电磁阀和出口电磁阀打开，由于旁通管路两端存在压力差，在压力差的作用下，出液口的液态冷媒能够进入膨胀罐中，实现快速卸压。并且在低温制冷循环回路中冷媒量较少时，可以仅打开出口电磁阀并降低设定温度，以便让膨胀罐内的冷媒进入低温制冷循环回路。