本发明涉及内镜清洗机设备的技术领域，尤其涉及一种内镜全自动清洗机水循环过滤器，包括外壳，所述外壳上部内侧设置有气室，所述外壳中部内侧设置有过滤室，所述外壳下部内侧设置有储水室，所述外壳上部设置有伸缩机构，所述伸缩机构下部贯穿外壳上部壁壳，所述伸缩机构下部设置有活塞，所述活塞外周滑动连接在气室内部，本发明当活塞向下移动时，对过滤机构完成反冲洗，当活塞向上移动时，使得过滤机构内外形成压力差，加快过滤机构对水的过滤速度，通过永磁体一、永磁体二和永磁体三的相互吸引，通过往复丝杠带动传动轴旋转，使得橡胶条一和橡胶条二旋转，将过滤网一上附着的污垢刮下，恢复过滤网一的过滤效率。