本发明公开了一种非担载型铱基纳米合金催化剂、制备方法及其应用，该催化剂以商用的能够酸洗去除的氧化锌作为硬模板的具有巢状结构的LaRuIr纳米合金催化剂，合金表面具有金红石型复合金属氧化物薄层；该催化剂的巢状结构是由通过共格外延生长相互连接的纳米颗粒自组装而成，纳米颗粒之间形成了大量的镧原子稳定的高密度的原子级共格界面；所述纳米颗粒尺寸为50.0～100.0nm；所述高密度的原子级共格界面作为酸性水氧化的稳定催化活性位点，用于提高催化剂的活性和长期稳定性。本发明通过纳米粒子自组装形成共格界面亚结构的方法，为设计新型高效的富含亚结构催化剂提供了新的思路，对质子交换膜水电解(PEMWE)具有重要意义。