本发明提供了一种具有抗菌功能的贝壳/木塑复合材料及其制备方法和应用，属于木塑复合材料技术领域。本发明首先对贝壳粉进行煅烧，使贝壳粉中的碳酸钙转换成氧化钙，从而具有抗菌活性和吸附性，然后将煅烧后的贝壳粉与纳米金属氧化物抗菌剂进行球磨复合，利用煅烧后的贝壳粉作为纳米金属氧化物的载体，形成纳米金属氧化物包裹贝壳粉的核壳结构，即改性贝壳粉，改性贝壳粉具有较好的生物相容性和稳定性，从而保证在其添加量较多时仍能够均匀分散在复合材料中，同时控制其他组分的组成和用量，使得复合材料同时具有优异的抗菌性能和力学性能。