本发明提供一种用于通信系统中的时延估计方法及装置，涉及通信信号处理技术领域，本发明采集N个信道的发送信号与接收信号，对所有发送信号与接收信号分别使用傅里叶变换将信号从时域转换为频域得到频谱数据。对频谱数据进行特征提取得到频域特征和第一频域时延估计值，使用互相关函数对第一频域时延估计值进行修正得到修正第一频域时延估计值，并将所有信道的修正第一频域时延估计值构成集合，使用集合内的修正第一频域时延估计值对信道进行补偿，对补偿后的数据进行处理，然后进行反补偿得到补偿信道估计谱，分析补偿信道估计谱得到信噪比，通过修正第一频域时延估计值、信号频域特征和信噪比得到第二频域时延估计值。