本发明提出了一种具有卵巢保养作用的组合物及其应用，包括如下重量份组分：植物复合异黄酮20～40份、原花青素提取物20～35份、复合提取物15～25份和木瓜蛋白酶2～8份。所述植物复合异黄酮提取物包括红车轴草异黄酮、大豆异黄酮和毛蕊异黄酮；所述原花青素提取物包括葡萄籽原花青素提取物和松树皮原花青素提取物；所述复合提取物包括葛根提取物和绿茶提取物。本发明提供的组合物，可降低环磷酰胺诱导卵巢早衰血清中的FSH和LH含量，对环磷酰胺诱导的卵巢早衰具有较好的保护作用，效果优于雌激素，同时，卵巢指数升高较多，效果优于雌激素，对卵巢具有良好的保护能力。