本发明涉及声医学与超声换能器设备领域，具体涉及一种超声探头水囊水处理装置及其处理方法，包括控制平台、充抽水设备、水流量监测设备、报警设备、注水瓶、废水箱、超声探头、操作台和通信端口，所述注水瓶和废水箱与充抽水设备连接，所述充抽水设备底部与超声探头连接，且充抽水设备一侧设置有排气口，所述超声探头包括超声探头水囊，超声探头水囊安装于超声探头底部；所述控制平台发出充水、抽水、排气指令，所述充抽水设备根据控制平台的指令进行工作，由水流量监测设备监测充水、抽水的水流量并将监测信息反馈至控制平台，实现精准停止充抽水设备的充水、抽水、排气动作，完成对超声探头水囊内的精确充水或抽水。