本发明涉及医疗图像压缩处理技术领域，具体涉及一种医疗大数据综合管理方法。本发明首先获取包含医疗图像的医疗大数据并对医疗图像进行分类；进一步根据初始图像集内图像之间的整体灰度相似特征，将初始图像集内的医疗图像分为相似图像集；进一步根据每个相似图像集内医疗图像的局部梯度相似特征，将相似图像集内的医疗图像分为待压缩医疗图像组；最后分别将每个待压缩医疗图像组的医疗图像进行一起压缩并存储。本发明从医疗图像的获取方式、整体灰度相似特征和局部梯度相似特征三个角度评估医疗图像之间的相似性，通过将相似的医疗图像一起压缩，提升医疗图像的压缩效率，减少储存空间并便于管理，更好适应医疗大数据的压缩需求。