本发明公开了一种中药材加工用磨粉设备及其工作方法，属于药材加工设备技术领域，包括箱体，箱体的内部安装有升降平台，升降平台的顶部安装有第二冷却箱，第二冷却箱的顶部安装有第二研磨盘，第二研磨盘的上方设有第一研磨盘，第一研磨盘的顶部连接有第一冷却箱，第一冷却箱的内部贯穿安装有多个连接在第一研磨盘上的第一导热棒。本发明通过第一冷却箱、第一导热棒、第二冷却箱和第二导热棒的设置，能够在使用时将第一研磨盘和第二研磨盘研磨时产生的热量，通过第一导热棒和第二导热棒导入第一冷却箱和第二冷却箱的内部，通过第一冷却箱和第二冷却箱内部的冷却液进行冷却，防止研磨时产生的热量对药材中的有效成分造成破坏。