本发明属于生物基材料单体的精制领域，具体涉及一种生物基半芳香族尼龙5X盐的绿色制备方法及其应用，在30℃~80℃惰性气体保护下，将生物基戊二胺水溶液滴加进芳香族二元酸悬浮水溶液中，超声和/或微波辅助条件下，得到澄清尼龙粗盐溶液，向尼龙粗盐溶液加入晶种进行结晶淋洗抽滤，并烘干得到生物基半芳香族尼龙5X盐，通过回收系统可回收戊二胺、芳香族二元酸、低碳醇和水，本发明引入超声和/或微波辅助手段，采用去离子水作为单体溶剂和分散剂，并加入晶种获得尼龙5X盐，具有成盐周期短、结晶速度快、外观质量好、绿色经济环保、有利于保存和运输等优点，同时为后续尼龙聚合提供了有利条件。