本发明提供了一种高亲水硅水凝胶及其制备方法和应用，属于隐形眼镜镜片材料领域。由包括以下用量的原料制得：单封端有机硅氧烷大分子单体20～60质量份，甲基丙烯酸酯类单体1～30质量份，亲水性单体25～60质量份，引发剂和交联剂；所述引发剂的质量为单封端有机硅氧烷大分子单体、甲基丙烯酸酯类单体和亲水性单体的质量总和的0.5～3％，所述交联剂的质量为单封端有机硅氧烷大分子单体、甲基丙烯酸酯类单体和亲水性单体的质量总和的0.5～3％。本发明通过添加甲基丙烯酸酯类单体，提高了硅水凝胶的表面亲水性，具有优异的透氧性和透光性。