本发明涉及脑电信号预处理技术领域，具体涉及一种用于癫痫病辅助诊断的脑电数据预处理方法，包括：获取癫痫患者的若干脑电信号及脑电信号中的关键脑电信号值；获取关键脑电信号值的最终癫痫特征值；根据关键脑电信号值的最终癫痫特征值的波动，得到癫痫轻度发作脑电信号和癫痫重度发作脑电信号；获取癫痫轻度发作脑电信号的癫痫特性值和癫痫重度发作脑电信号的癫痫特性值；根据最终癫痫特征值、癫痫特性值对关键脑电信号值进行修正，构建原始脑电信号矩阵；获取源信号矩阵并进行降维处理，得到若干降维后的源信号。本发明在减少数据维度高的同时提高降维后的源信号反映癫痫的特性。