本发明属于细胞生物学、生物化学和分子生物学等技术领域，公开了一种利用拟南芥细胞悬浮系制备完整叶绿体的方法。该方法首先利用酶解法进行悬浮细胞原生质体的制备，然后利用匀浆器进行原生质体的破碎后通过离心分离获得完整的叶绿体。与现有技术相比，本发明可以减少传统叶绿体提取过程中的限制条件，提高制备效率，同时发明利用拟南芥细胞悬浮系，可以延缓叶绿体成熟时间、捕捉发育早期的叶绿体，针对研究需求选择不同发育阶段的叶绿体进行制备，用于叶绿体相关机制研究。本发明具有重要的应用价值。