本发明公开了一种灌装剂量自动识别方法及系统，涉及剂量识别技术领域。该方法包括：在灌装前对灌装容器进行识别，包括：建立剂量识别模型；生成目标剂量和灌装控制指令；在灌装过程中根据灌装控制指令对灌装设备和灌装参数进行调控；在灌装后对灌装容器进行剂量检测，若灌装后的实际剂量与灌装前的目标剂量一致则进行后续流程；若不一致则进行误差检测以获取误差剂量并根据误差剂量进行剂量补充。本发明通过在灌装前对灌装容器进行识别、在灌装过程中对灌装设备进行调控以及在灌装后对灌装容器进行剂量检测，提升灌装的自动化水平、提高加工效率、灌装质量和灌装剂量的精度。