本发明涉及水体底泥取样技术领域，尤其涉及一种水体底泥取样器。本发明提供一种能够在对水体底泥进行挖取时避免泥样搅动混合，保证水体底泥样本的完整性的水体底泥取样器。一种水体底泥取样器，包括有安装架、吊绳、连接轴、取样斗和扭簧，安装架顶部连接有吊绳，安装架下部前后两侧均转动式连接有连接轴，连接轴之间连接有取样斗，连接轴均与安装架之间连接有扭簧。本发明通过安装架向下移动使得拨动架受到拨块的挤压限制，带动锁销滑动，使得锁销与取样斗脱离，此时扭簧得以回弹，带动连接轴旋转一百八十度的操作，能够在对水体底泥进行挖取时避免泥样搅动混合，保证水体底泥样本的完整性。