本发明涉及一种结合指标率的招采结算系统，针对供货企业与医疗机构之间的医用耗材采购过程，设计供货企业终端和医疗机构终端，并结合医保部门所对应的医保部门终端，通过三终端彼此之间的交互通信、以及对系统所设计其他各模块的调用，实现三方关于医用耗材的采购与结算，并且在整个应用过程中，建立供货企业关于医用耗材采购清单的配送率、供货企业关于所配送医用耗材总金额的申请率、医疗机构关于供货账单的确认率、医疗机构关于所确认供货账单的付款率、以及医保部门的结算率，综合五率，对供货企业、医疗机构、医保部门三方在采购过程中的工作进行监督，实现采购过程中各环节数据的量化与监督，综合提高了整个医用耗材采购过程的工作效率。