本发明公开了一种机组飞车偏航自动应急系统，包括：叶轮转速检测装置，设置于风力发电机组上，用于检测风力发电机组叶轮的旋转速度；机组偏航模块，用于对风力发电机组进行偏航；应急偏航控制电路，与叶轮转速检测装置和机组偏航模块连接，用于在风力发电机组发生超速飞车时，进行紧急偏航背离风向；偏航控制模块，与叶轮转速检测装置、机组偏航模块和应急偏航控制电路连接，在叶轮转速检测装置检测到叶轮转速超过设定阈值时，根据应急偏航控制电路控制机组控制模块对机组进行紧急偏航；通过应急偏航控制电路与机组偏航模块对机组进行偏航背离风向，减少了机组飞车事故的发生，避免了经济损失。