本发明提供了一种聚酯纤维整理剂及其制备方法和应用，所述聚酯纤维整理剂是以不饱和脂肪族二元羧酸、芳香族二元醇和二巯基化合物制备所得。二巯基化合物通过自身的巯基与不饱和脂肪族二元羧酸所含双键通过自由基加成反应，作为由不饱和脂肪族二元羧酸和芳香族二元醇制备所得的聚酯分子侧链存在，然后另一巯基与环氧基有机硅烷化合物开环加成反应，最终制得所述聚酯纤维整理剂。所得聚酯纤维整理剂通过一定的处理方式用于聚酯纤维，在聚酯纤维中引入了既稳定又高度可逆的二硫动态共价键，在提高纤维表面自修复性的同时，也可实现纤维耐久性和透湿透气性的改善。