本申请公开了一种增材制造制件几何形貌监测方法、系统和存储介质，应用于增材制造技术领域，方法包括：获取并预处理增材制造实验的熔池的几何图像、熔覆层的温度图像和熔覆道的时空坐标信息；将瞬态热传导物理定律嵌入到CNN的损失函数，利用实验数据训练基于CNN的神经网络模型，得到监测模型；根据当前工艺参数进行增材制造，获取并预处理当前的几何图像、温度图像和时空坐标信息，得到当前融合图像，结合监测模型的检测，得到制件的形貌检测结果；当结果为不合格且缺陷能修复时调整工艺参数，返回根据当前工艺参数进行增材制造的步骤，直到增材制造结束。本申请提高制件缺陷监测的精度和增材制造过程的可控性，确保制件的质量和稳定性。