本发明涉及生物技术领域，具体来说是一种青稞品种鉴定的SSR分子标记引物组、试剂盒及应用，所述SSR分子标记引物含有21对，按每条染色体3对引物定位在青稞的7条染色体上。本发明的SSR分子标记引物PIC值在0.44～0.85之间，平均为0.70，21个标记中20个的PIC值高于0.5，为高度多态性位点，表明SSR分子标记引物的多态性较高。与现有技术相比，SSR的引物多态性更高，鉴定效率更优，本发明提供的SSR引物具有特异性强、扩增结果稳定、多态性高等特征，这些分子标记可应用于品种鉴定、基因定位、分子鉴定等相关领域。