本发明公开了一种基于S2C的目标方位角估计方法、系统和设备，方法包括以下步骤：根据水声信道中发射端发出的用于测试的信号到达接收端的最小多径时延和时延拓展，设计S2C信号并发出；采用互相关方法利用本地线性调频信号对S2C信号进行匹配滤波，得到信号到达时刻作为起始时刻，从起始时刻开始截取长度为一个扫频周期的接收信号Rx；用本地线性调频信号对Rx做相关接收，得到不同路径和时延的相关接收信号Rxi；根据最小多径时延设计低通滤波器，在频域上对Rxi做多径分离，得到直达径；采用超短基线六元阵列，利用直达径进行常规波束成形，估计目标方位角。本发明有效降低了多径效应的影响，提高了目标方位角的估计精度。