本发明公开了一种花椰菜香味基因BoBADH2及其靶向sgRNA和应用，属于花椰菜育种技术领域。所述基因BoBADH2的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示。鉴于所述花椰菜香味基因通过负调控影响花椰菜香味物质含量，本发明还提供了一种靶向花椰菜香味基因的sgRNA或基因编辑系统在构建富含香味物质的花椰菜品系中的应用。本发明利用CRISPR/Cas9系统创制了BoBADH2突变株，利用pORE‑Cas9/gRNA载体使花椰菜中BoBADH2基因发生移码突变，使得到的花椰菜突变体中香味物质含量比野生型具有极显著的提高。经实验可知本发明花椰菜香味基因BoBADH2通过负调控方式影响花椰菜中香味物质含量，因此本发明提供的花椰菜香味基因为花椰菜育种提供了有效靶点。