本发明公开了一种抗菌肽Thanatin衍生肽及其医药用途，该抗菌肽Thanatin衍生肽的氨基酸序列如SEQ ID NO.1～55所示的任一条。该组抗菌肽对多种临床多重耐药菌表现出不同的抗菌活性，且不具备任何溶血性和细胞毒性；可用于制备抗多重耐药菌感染的药物；本发明制备工艺稳定、简单，适合于大规模工业化生产；将上述结构的肽单独使用或者组合使用作为其他药物的辅料，或作为食品、化妆品、饲料的添加剂；既能治疗耐药菌引起的感染，又不诱导耐药性细菌的产生；在肽被体内酶水解后能够变成人体可利用的氨基酸，无残留问题，对环境友好。