本发明提供了一种防结石的脱细胞基质复合膜及其用途，本发明制得的脱细胞基质复合膜通过两层脱细胞基质膜包夹一层高分子膜制备而成，所述脱细胞基质膜为猪小肠、猪膀胱、猪皮中的至少一种生物材料制备而成的，所述高分子膜为聚己内酯、聚二甲基硅氧烷、聚氨酯、聚乳酸‑羟基乙酸、聚乙烯醇、聚羟基脂肪酸酯中的至少一种高分子材料制备而成的。本发明制备的脱细胞基质复合膜具有防结石的效果，可让患者痛苦更小、恢复更快、生活更好、花费更少，同时节约医疗资源，亦可为部分回肠原位新膀胱术禁忌患者带来治疗希望。