本发明公开了一种sRNA结合茎尖超低温疗法脱除啤酒花矮化类病毒的方法，属于脱毒良种生产技术领域。所述sRNA包括如SEQ ID NO：5所示的正义链和SEQ ID NO：6所述的反义链。所述方法包括以下步骤：用sRNA处理感染啤酒花矮化类病毒的番茄茎，得到啤酒花矮化类病毒被抑制的样本；将类病毒被抑制的样本进行消毒处理后获取茎尖，再将所述茎尖进行预培养和加载；加载后的所述茎尖用冷冻保护液PVS2处理，之后进行超低温处理、卸载和后培养，得到脱毒样本。该方法能够脱除一般在植物上无法脱除的类病毒，且无需较长时间的类病毒低温钝化处理，本发明适用于在番茄上快速地获得除啤酒花矮化类病毒的脱毒苗。