本发明属于新能源电源控制技术领域，尤其涉及一种构网型储能电站的故障穿越控制方法和系统。所述控制方法包括如下步骤：在储能电站构网型控制逆变器中无功电压环的电压参考值与电压实际值的差值在故障期间归零；检测储能电站逆变器出口侧的跌落电压值；根据所述储能电站逆变器出口侧的跌落电压值，计算逆变器需向电网提供的无功功率和有功功率；在故障期间将无功功率参考值、有功功率参考值重置为上述计算得到的无功功率、有功功率。本发明能够在故障期间保证逆变器电压源特性的同时提高构网型储能电站的故障穿越能力。