本发明公开了一种复杂背景红外图像复合绝缘子发热缺陷自动识别方法及系统。目前的识别方法依赖人工操作，或需要先验设备参数，或对复杂背景红外图像中复合绝缘子的分割定位精度不足，限制了大量红外图像的快速处理。本发明通过图像处理实现山体、地面、杆塔等复杂背景红外图像中复合绝缘子芯棒中轴线的定位及其温度曲线的获取，并采用结合无人机红外自主航线参数获得温度曲线所对应复合绝缘子区域的长度，进而通过芯棒中轴线温度低频分量梯度绝对值的最大值、芯棒中轴线温度低频分量梯度峰度，判断目标复合绝缘子是否存在发热缺陷，在实现不依赖先验信息的前提下，显著提升了现场复杂背景复合绝缘子设备红外检测及分析的精度。