本发明属于故障诊断技术领域，具体涉及一种风机故障诊断方法及系统，包括：1)获取风机组运行数据，并记为原始数据集，所述风机组运行数据包括正常数据和故障数据；2)对所述原始数据集进行过采样处理，生成符合故障数据特征的合成样本集，所述合成样本集与原始数据集构成增强训练集；3)提取增强训练集的数据特征，利用提取特征后的增强训练集训练构建的分类模型，训练完成得到故障诊断模型；4)将待测风机组运行数据的数据特征输入至所述故障诊断模型进行故障诊断，输出故障分类结果。由此本发明解决了现有技术中风机组故障诊断精确度低的问题。