本发明公开一种磁通切换式磁悬浮双飞轮储能装置，包括双飞轮和电机，双飞轮包括从外向内依次设置的外飞轮、内飞轮和中心柱，内、外飞轮通过轮毂连接，飞轮中心柱中部连接飞轮圆盘，内飞轮为圆柱的离散结构，外飞轮为鼓状的连续结构；内外飞轮之间的上部空隙用于固定上轴向定子、上径向辅助斥力环，下部空隙用于固定下轴向定子、下径向辅助斥力环；中心柱与内飞轮之间上部空隙用于固定上径向定子、上轴向辅助斥力环，下部空隙用于固定下轴向辅助斥力环和下径向定子；轴(径)向定子包括多个定子齿，定子齿中夹有永磁体，定子齿上缠绕绕组，相邻的定子齿通过容错齿隔开。本发明使得磁悬浮双飞轮储能装置的安全性更好、集成度更高、储能性能更优。