本发明公开了生物基聚氨酯包衣树脂，其原料按质量份包括：A组分：聚醚多元醇40‑50份，蓖麻油30‑40份，季戊四醇5‑15份，催化剂0.1‑0.5份，无机填料10‑30份；B组分：2,4‑二苯基甲烷二异氰酸酯1‑2份，4,4‑二苯基甲烷二异氰酸酯1‑2份，聚醚胺1‑2份，端羟基聚丁二烯1‑2份；C组分：铈活化乳酸1‑2份；其中铈活化乳酸采用硝酸铈加入含有乳酸和硅烷偶联剂的溶液中得到。本发明公开了上述生物基聚氨酯包衣树脂使用方法。本发明所得包衣树脂不仅不易脱落，而且膜层不易出现裂缝，结构稳定性极高，同时具有优异的韧性与耐水性，从而有利于延长肥料的缓释期。