本发明公开了基于多级平台的工程审计审价数据安全处理方法及系统，包括：基于业务执行路径构建审计审价任务链；获取每个执行对象层级所对应的待审计节点编号；按待审计节点编号采用层级密钥依次对待审计节点进行加密；将加密后的审计审价任务链按归类结果进行切割并分发至对应的审批终端进行审核；对应审批终端基于层级密钥对加密后的待审计节点进行解密，依次输出审计子结果；基于审计子结果对对应的待审计节点编号进行状态赋值，并基于业务执行路径对基于待审计节点编号进行顺序重排，得到当前审计审价任务链的审计状态结果。本方案可以提高审计审价任务链的审批效率和准确性，并进一步保障审批环节的安全性。