本发明申请提供一种含钴萃铜余液除锰回收钴的方法，属于有色冶金技术领域。本发明中的方法，包括以下步骤：S1.将含钴萃铜余液进行氧化，并加入中和剂进行中和沉钴锰，液固分离后得到钴锰渣；S2.将钴锰渣加入到含钴萃铜余液中进行浸出，浸出钴并再次沉锰，液固分离后得到浸出后液和锰富集物；S3.在浸出后液中加入氧化镁进行中和沉钴，液固分离后得到沉钴渣，沉钴渣水洗后，即得到钴富集物。本发明通过两次沉锰过程，显著提升了浸出后液中钴锰的质量比，这样浸出后液在进行中和沉钴时，不仅钴更加容易沉降进入到钴富集物中，而且进入到钴富集物中的杂质锰含量相对更少，最终使得钴富集物中钴品位得以显著提升，钴富集物的品质更高。