本发明公开了一种抽水蓄能电站高速采集数据同步方法及系统。所述方法包括：在发送端，对采集的数据进行分组，不同分组的数据采用多线程并行处理，并经由不同的网络通道进行发布，对每组数据的处理包括：按照指定格式组装数据帧报文，根据发送顺序将当前分组内数据分为第一帧、第二帧和后续帧三种类型报文，对报文中的部分信息利用压缩算法在不同类型的帧之间进行压缩，并将单封报文的长度限制在指定范围内；在接收端，接收到报文后，根据报文格式获取各部分内容，并利用压缩算法的反向计算还原被压缩的信息。本发明通过分组进行多通道并行同步策略，提高水电站高速采集数据的同步效率。