本发明公开了一种适用于枫香树不同组织荧光定量PCR的内参基因及其专用引物和应用，属于植物分子生物技术领域。本发明以枫香树的5个不同组织为实验材料，依次通过荧光定量PCR分析，扩增曲线和熔解曲线分析，LinRegPCR扩增效率分析，BestKeeper、geNorm、NormFinder、Delta Ct和RefFinder基因表达稳定性分析，获得2个表达稳定的内参基因LifUBQ和LifACT。该内参基因LifUBQ和LifACT适用于枫香树不同组织的荧光定量PCR，填补了枫香树没有内参基因的现状，为枫香树叶色变异相关功能基因的精确定量提供数据支持，可提高研究的稳定性和准确性。